生物信息学与数据科学

UNMCCC 生物信息学和数据科学 (BDS) 共享资源通过提供全面的计算和分析服务支持基础、转化和临床癌症研究。

这些服务包括

  • 研究设计和开发，
  • 下一代测序（NGS）数据分析，
  • 单细胞和空间转录组学，
  • 化学信息学，
  • 癌症信息学，以及
  • 先进的统计和数据科学方法。
生物信息学图像

BDS 成员与 分析和转化基因组学 和 生物统计学 共享资源以增强从 NGS 和其他基因组和转录组数据中获取知识。

北斗共享资源

  • 为数据存储、高性能计算和基于云的解决方案（包括通过 NIH STRIDES 计划进行的 AWS 集成）提供关键基础设施，以及
  • 管理 CRIIS，这是一个独特的癌症信息学平台，集成了临床、基因组、肿瘤登记和社会人口统计数据，该平台是在 UNMCCC 和新墨西哥州的支持下与当地一家数据分析公司合作开发的。

生物信息学共享资源

杰里米·爱德华兹博士

联合主任

给 Edwards 博士发送电子邮件

克里斯·阿莫斯博士

联合主任

凯瑟琳（查理）布雷耶博士

生物信息学家，数据分析

Olufunmilola (Funmi) Oyebamiji, MS

生物信息学家，数据分析

Inigo San Gil 博士

IT服务专家

肖向军，硕士

高级数据科学家

癌症研究机构（CRF）： 一楼，100A室

要确认使用此共享资源，请在您的出版物中包含以下内容：

这项研究得到了 UNM 综合癌症中心支持赠款 NCI P30CA118100 和生物信息学和高维数据分析共享资源的部分支持。

生物信息学和数据科学具体目标

目标 1：通过具有成本效益的服务、技术、设备和专业知识提供信息学、分析和知识管理支持，以支持三个 UNMCCC 研究计划。

BDS 的首要任务是为 UNMCCC 成员提供复杂高维数据分析方面的专业知识，并支持实现 UNMCCC 三个研究项目研究目标所需的软件、计算需求和综合知识。随着基因组学（尤其是空间基因组学）的进步，BDS 预计对复杂组学数据分析的需求将日益增长。

BDS 采用协作模式，与 ATG 和生物统计学共享资源协作，为研究人员提供经济高效的研究设计方法，并分析复杂专业的数据，同时为研究人员提供获取专业数据分析方法和能力的途径。此外，BDS 将管理 UNMCCC 成员对 CRIIS 的使用，并对其进行培训，提供数据分析和解读方面的建议。

目标 2：开发适合 UNMCCC 研究需求的定制生物信息学工具和流程。

BDS 将继续开发与癌症中心成员需求紧密相关的工具，尤其是在空间生物学领域。此外，BDS 还将通过开发一个安全的数据分析、存储和分发平台，用于存储可识别的患者健康信息和 UNMCCC 生成的基因组数据，在提升 CRIIS 的实用性方面发挥关键作用。

目标 3：提供教育并提高对生物信息学技术和服务的认识。

BDS 主任负责撰写季度简报，重点介绍和讲解 BDS 的服务和技术，并协助用户准备涉及复杂或高维数据分析的竞争性资助提案。主任们出席研究项目和其他 UNMCCC 会议，提供专业知识、建议和信息，介绍 BDS 提供的技术和服务，以及生物信息学新方法和方法的最新进展。Edwards 主任积极参与新墨西哥大学工程学院的生物信息学研究生项目，并在研究生核心课程中讲授生物信息学。

教职员工

爱德华兹形象杰里米·爱德华兹博士

生物信息学与数据科学共享资源联合主任

化学与化学生物学教授

化学与生物工程教授

分子遗传学和微生物学教授

教育和培训

哈佛医学院遗传学博士后培训

加州大学圣地亚哥分校生物工程博士

加州大学圣地亚哥分校生物工程硕士

德克萨斯大学阿灵顿分校机械工程学士学位

研究兴趣

生物信息学、基因组技术、下一代测序技术、系统生物学、信号通路的空间调控。

阿莫斯-克里斯-600px.jpg克里斯托弗·阿莫斯博士

HSC 数据科学计划负责人

UNMCCC人口与数据科学副主任

生物信息学与数据科学共享资源联合主任

新墨西哥大学内科系、流行病学、生物统计学和预防医学系教授

教育和培训

医学遗传学委员会认证

美国国立卫生研究院跨机构医学遗传学培训项目博士后培训

路易斯安那州立大学医学中心生物统计学和遗传学博士

路易斯安那州立大学医学中心生物统计学和遗传学硕士

里德学院理学学士。 

研究兴趣

阿莫斯博士的职业生涯主要致力于开发和实施了解常见癌症病因的遗传和环境影响的方法。